Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms