Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms