Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cald1E9QA15 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms