Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms