Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DspE9Q557 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DspE9Q557 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms