Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms