Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf11E9PZM7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms