Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Parp4E9PYK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms