Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU019823E9PUQ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU019823E9PUQ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms