Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Soga1E1U8D0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms