Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldlrad1D3YYZ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldlrad1D3YYZ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms