Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf217D3YYI7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms