Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kpna7C0LLJ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna7C0LLJ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms