Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol7aB2RT54 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms