Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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