Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scn3aA2ASI5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms