Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm12A2AJ77 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm12A2AJ77 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms