Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sec16aA2AIX1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms