Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm11A2AGX3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms