Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem185aA2AF53 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms