Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp8nlA2ABX0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms