Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700023F06RikA2AB62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms