Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd5A2A8L1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd5A2A8L1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms