Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
U3KQE9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
U3KQE9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
U3KQE9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
U3KQE9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
U3KQE9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
U3KQE9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
U3KQE9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQE9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQE9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms