Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms