Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn8Q9Z260 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms