Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek4Q9Z1J2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms