Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp2Q9Z0E6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp2Q9Z0E6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms