Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn5Q9WU28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms