Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zeb2Q9R0G7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zeb2Q9R0G7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms