Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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