Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk3Q9QZL0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk3Q9QZL0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms