Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Map1aQ9QYR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms