Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms