Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrfQ9JM73 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms