Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cabp1Q9JLK7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp1Q9JLK7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp1Q9JLK7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms