Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms