Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc17Q9ESX4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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