Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DysfQ9ESD7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms