Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk4Q9ERK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk4Q9ERK0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms