Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slco1c1Q9ERB5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms