Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm2aQ9DAR1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms