Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tbc1d20Q9D9I4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tbc1d20Q9D9I4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tbc1d20Q9D9I4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tbc1d20Q9D9I4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Tbc1d20Q9D9I4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Tbc1d20Q9D9I4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Tbc1d20Q9D9I4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tbc1d20Q9D9I4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tbc1d20Q9D9I4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tbc1d20Q9D9I4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tbc1d20Q9D9I4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tbc1d20Q9D9I4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms