Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlirpQ9D8T7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms