Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms