Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf6Q9D4J7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms