Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pus10Q9D3U0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pus10Q9D3U0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms