Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrp7aQ9D1C9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp7aQ9D1C9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp7aQ9D1C9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.1 ms