Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd3Q9D176 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd3Q9D176 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms