Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp3Q9D032 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp3Q9D032 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms